La investigación que abrió la sala penal, se dio luego de que un testigo del escándalo de la parapolitica, lo acusara de haberse reunido en el 2001 , con el jefe del bloque Tolima de las autodefensas.

Ante la investigación, el senador García anunció oficialmente su renuncia "Me margino de la dirección de ‘la U’ y continuaré en el Senado haciendo las funciones legislativas y atendiendo el llamado de la Corte, para aclarar mi  conducta, que no ha estado involucrada en actos que comprometan la ilegalidad".

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La investigación compromete también a la representante a la Cámara por Nariño Mariam Paredes y el senador del mismo departamento Eduardo Enríquez Maya.